ngµç×ÓÓÎÏ·

05

¿ÆÑÐÏ£Íû

Àî²Ê¿ÎÌâ×鿪·¢»ùÓÚÉî¶Èѧϰ¹¹½¨»ùÒò×éÍ»±äÂÊͼÆ×µÄͨÓÃÒªÁì

¸å¼þȪԴ£º£º£ºÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§Ôº ±à¼­£º£º£ºÌ¸Ï£¡£¡£¡¢Íõ¶¬Ã· ÉóºË£º£º£ºÖª×ã ÔĶÁÁ¿£º£º£º

ngµç×ÓÓÎÏ·ÐÂÎÅÍøÑ¶£¨Í¨Ñ¶Ô±Àî²Ê£©ÉúÎïÌåµÄ»ùÒò×éÐòÁÐÔÚ´«´úÀú³ÌÖв»¿É×èÖ¹»á±¬·¢Í»±ä£¬»ùÒò×éÍ»±äÊÇÒÅ´«¶àÑùÐԵĻù´¡£¬Ò²ÊÇÉúÎïÑÝ»¯µÄÖ÷Òª¶¯Á¦Ö®Ò»¡£¡£¡£¡£»£»£»ùÒò×éÍ»±äÂÊÊÇÐí¶àÒÅ´«ºÍÑÝ»¯ÆÊÎöµÄÖ÷Òª²ÎÊý¡£¡£¡£¡£ÀýÈ磬ͻ±äÂÊ¿ÉÒÔÓÃÓÚ¹ÀËãij¸ö»ùÒò×éÇøÓòµÄÔ¤ÆÚÍ»±äÊýÄ¿£¬Í¨¹ý½ÏÁ¿Í»±äÊýÄ¿µÄÔ¤ÆÚÖµºÍȺÌåÀïµÄÊÓ²ìÖµ¿ÉÔ¤¼Æ¸ÃÇøÓòÊܵ½µÄÑ¡ÔñѹÁ¦Ç¿¶È´Ó¶ø·¢Ã÷Ö÷ÒªµÄ¹¦Ð§ÇøÓò»ò±äÒìλµã¡£¡£¡£¡£ËäÈ»ÈýÊ®¶àÄêǰ¾ÍÒÑ·¢Ã÷»ùÒò×é²î±ðÇøÓòµÄÍ»±äÂʲî±ðºÜ´ó£¬È»¶ø¹¹½¨Ò»¸ö»ùÒò×éµÄ¸ß¾«¶È¡¢¸ß·Ö±æÂʵÄÍ»±äÂÊͼÆ×ºÜÊÇÄÑÌ⣬ÏÖÓÐÒªÁìÖ»ÄÜ»ñµÃ»ùÒò×éÍ»±äÂʵĴֲÚÔ¤¼Æ£¬ÇÒÄÑÒÔÓ¦Óõ½Ò»°ãÎïÖÖÖУ¬Òò´ËÊÇÒÅ´«ºÍ·Ö×ÓÑÝ»¯ÁìÓòÖÐÓдý½â¾öµÄÖ÷ÒªÎÊÌâ¡£¡£¡£¡£

¸ÃÎÊÌâµÄÄÑÌâÖ®Ò»ÊÇ£¬ÉúÎï¸öÌåÿһ´ú±¬·¢µÄÐÂÉúÍ»±ä£¨de novo mutations£©ºÜÊÇÉÙ£¬ÔÚ»ùÒò×éÂþÑܼ«ÆäÏ£º±¡£¡£¡£¡£ÀýÈ磬ÈËÀà¸öÌåÖÐÿһ´úÖ»ÓÐԼĪ50¸öÐÂÉúµÄµãÍ»±ä£¬¶ø¼ì²âÐÂÉúÍ»±äÐèÒª¶ÔâïÊѺÍ×Ó´ú¾ÙÐÐÈ«»ùÒò×é²âÐò£¬Òò´Ë»ñÈ¡´ó×ÚµÄÐÂÉúÍ»±ä×÷Ϊģ×ÓѵÁ·Êý¾ÝµÄ±¾Ç®ºÜÊǸß¡£¡£¡£¡£ÁíÒ»¸öÄÑÌâÊÇ£¬ÒÑÖªÓÐÐí¶àÒòËØÓëÍ»±äÂÊÏà¹ØÇÒ¹ØÏµÖØ´ó£¬ÈçÏà½üÐòÁС¢¸´ÖÆÊ±¼ä¡¢DNA¼×»ù»¯¡¢ÖØ×éÂʵÈ£¬ÔõÑù¶ÔÖÚ¶àÒòËØ¾ÙÐн¨Ä£À´Ô¤²âÍ»±äÂÊÒ²ÊÇÒ»¸öÖØ´óÌôÕ½¡£¡£¡£¡£¹ØÓÚµÚÒ»µã£¬½üÄêµÄÑо¿Åú×¢£¬²âÐòȺÌåÖеÈλ»ùÒòƵÂʺܵ͵ÄÓÐÊý±äÒ죨rare variants£©ÓÉÓÚ·ºÆðʱ¼ä½Ï¶Ì£¬¿É×÷ΪÐÂÉúÍ»±äµÄ½üËÆ£¬Ò»¶¨³Ì¶ÈÉÏ»º½âÁ˽¨Ä£Ê±ÑµÁ·Êý¾ÝϡȱµÄÎÊÌâ¡£¡£¡£¡£µ«¹ØÓÚµÚ¶þµã£¬ÏÖÓÐÒªÁìÒ»°ãÊǼòÆÓµÄÏßÐÔ»ò¹ãÒåÏßÐÔÄ£×Ó£¬Ö»Ë¼Á¿ÉÙÁ¿Ïà½üÐòÁеÄÐÅÏ¢£¨²»Áè¼Ý10¸ö¼î»ù£©£¬Í¨³£»£»£»¹ÐèÒª´ó×ÚµÄÍ»±äÊý¾Ý¼°¹¦Ð§»ùÒò×éÌØÕ÷À´ÑµÁ·Ä£×Ó£¬ÕâЩÎÊÌâÏÞÖÆÁËÄ£×ÓµÄÔ¤²âÐÔÄܺͿçÎïÖÖÓ¦ÓÃ4,5¡£¡£¡£¡£

½üÄêÀ´£¬Éî¶ÈѧϰҪÁìÔÚÐí¶àÖØ´óÔ¤²âÀàÎÊÌâÉÏÌåÏÖÍ»³ö£¬ÔÚ»ùÒò×éѧÖеÄÓ¦ÓÃÒ²ÈÕÒæÔö¶à¡£¡£¡£¡£ÓÉÓÚ»ùÒò×éÐòÁÐ×Ô¼º¶ÔÍ»±äÂÊÓÐ×ÅÖ÷ÒªÓ°Ï죬ҲÓëÐí¶à¹¦Ð§»ùÒò×éÌØÕ÷Ç×½üÏà¹Ø£¬×÷ÕßÍÆ²âͨ¹ýÉî¶ÈÉñ¾­ÍøÂçÄ£×Ó¿ÉÒÔѧϰ´ó¹æÄ£µÄÏà½üÐòÁÐÀ´»ñµÃÓëÍ»±äÂÊÏà¹ØµÄÐÅÏ¢£¬½ø¶ø»ñµÃ¸üºÃµÄÍ»±äÂÊÔ¤¼Æ¡£¡£¡£¡£»£»£»ùÓÚ´Ë£¬À´×Ôngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºµÄÀî²Ê¿ÎÌâ×é¿ËÈÕÔÚNature Machine IntelligenceÔÓÖ¾ÉϽÒÏþÁËÌâΪ¡°A generalizable deep learning framework for inferring fine-scale germline mutation rate maps¡±µÄÑо¿£¬¸ÃÑо¿Ìá³öÁËÒ»ÖÖ»ùÓÚÉî¶Èѧϰ¹¹½¨»ùÒò×é¸ß¾«¶ÈÍ»±äÂÊͼÆ×µÄͨÓÃÒªÁ졪MuRaL (Mutation Rate Learner£©¡£¡£¡£¡£×÷ÕßʹÓÃMuRaL¹¹½¨ÁËÈËÀ༰¶à¸öÎïÖֵĸßÖÊÁ¿Í»±äÂÊͼÆ×£¬ÏÔʾ³ö¸ÃÒªÁìµÄÆÕ±éÊÊÓÃÐÔ¡£¡£¡£¡£

MuRaLÒÔÏà¶Ô½ÏÉٵĵãÍ»±äÊý¾Ý¼°´ó¹æÄ£µÄÉÏÏÂÓÎÐòÁÐÀ´ÑµÁ·Ä£×Ó£¬»ùÓÚѵÁ·ºÃµÄÄ£×Ó¿ÉÔ¤²âÈ«»ùÒò×éÿ¸ö¼î»ùµÄµãÍ»±ä¸ÅÂÊ¡£¡£¡£¡£MuRaLÄ£×Ó¿ò¼ÜÓÉ¡°local¡±ºÍ¡°expanded¡±Á½¸öÄ£¿é×é³É£¨Í¼1£©£¬»®·ÖÓÃÓÚѧϰËù¹Ø×¢Î»µãµÄ½ü¶ËºÍÔ¶¶Ë²àÒíÐòÁеÄÍ»±äÏà¹ØÐÅÏ¢¡£¡£¡£¡£ÆäÖУ¬½ü¶ËÐòÁÐԼΪÉÏÏÂÓÎ10 bp£¬¶øÔ¶¶ËÐòÁÐÔò°üÀ¨ÉÏÏÂÓÎ1 Kb»ò¸ü´óµÄ³¤¶È¡£¡£¡£¡£MuRaLͨ¹ý²î±ðµÄÉñ¾­ÍøÂçÄ£¿é»®·Ö¶ÔÕâÁ½·½ÃæÐÅÏ¢¾ÙÐÐѧϰ£¬È»ºó»ã×ÜÁ½¸öÄ£¿éµÄÊä³ö»ñµÃ×îÖÕµÄÔ¤²âЧ¹û¡£¡£¡£¡£


DE432F9673C512A1B626EF99873_344C8A1A_1A892

ͼ1. MuRaLÄ£×ӵļܹ¹


×÷ÕßʹÓÃÈËÀàÒÅ´«±äÒìÊý¾Ý¿âgnomADngµç×ÓÓÎÏ·Á¿µÄµÍƵÓÐÊý±äÒ죨×÷ΪÐÂÉúÍ»±äµÄ½üËÆ£©¾ÙÐÐÏêϸµÄÄ£×ÓÆÀ¹À¡£¡£¡£¡£Ð§¹ûÅú×¢£¬Ïà¹ØÓÚÒÑÓÐÄ£×Ó£¬MuRaLÔÚ²î±ð±ê×¼É϶¼ÓиüºÃµÄÔ¤²â׼ȷ¶È£¬²¢ÇÒ¶ÔѵÁ·Êý¾ÝµÄÒªÇóµÍÐí¶à¡£¡£¡£¡£ÒÔÈËÀà»ùÒò×éΪÀý£¬Ö®Ç°ÌåÏÖ×îºÃµÄCarlsonµÈÈ˵ÄÄ£×Ó4ÐèÒª¼¸ÍòÍòµÄÓÐÊý±äÒìºÍÖÚ¶àµÄ¹¦Ð§×éÑ§ÌØÕ÷¾ÙÐÐѵÁ·¡£¡£¡£¡£MuRaLÄ£×ÓÓÃÓÚѵÁ·µÄÍ»±äÊý¾Ý²»µ½CarlsonÄ£×ӵĶþÊ®·ÖÖ®Ò»£¬ÇÒ²»ÒÀÀµÈκι¦Ð§×éѧÊý¾Ý£¬µ«ËùµÃµÄÔ¤²âЧ¹û±ÈCarlsonÄ£×Ó¸üºÃ¡£¡£¡£¡£²»µ«ÔÆÔÆ£¬×÷Õß·¢Ã÷£¬»ùÓÚ100¸ö¸öÌåÖеÄÓÐÊý±äÒì¾ÙÐÐѵÁ·Óë1000¸ö¸öÌåÖеÄÓÐÊý±äÒìѵÁ·µÄÄ£×ÓÏà²î²»´ó£¨Í¼2£©£¬ÕâÒâζ×ÅÔÚ²âÐò¸öÌåÊýĿδ¼¸µÄÇéÐÎÒ²¿ÉÒÔÓÃMuRaLÀ´¹¹½¨»ùÒò×éµÄÍ»±äÂÊͼÆ×¡£¡£¡£¡£


4EB8A5F634BDFE1B293215414AC_9CF850CE_23044

ͼ2. »ùÓÚ100¸öÈ˺Í1000¸öÈ˵ÄÓÐÊý±äÒì¹¹½¨µÄMuRaLÄ£×ÓµÄÔ¤²âЧ¹û²î±ð²»´ó


ÓÉÓÚMuRaL¶ÔѵÁ·Êý¾ÝÒªÇóµÍ£¬ÕâΪ¹¹½¨Ðí¶àÎïÖÖµÄÍ»±äÂÊͼÆ×ÕÒ¿ªÁËÒ»ÉÈÃÅ¡£¡£¡£¡£×÷ÕßʹÓÃMuRaL»ñµÃÁ˺ãºÓºï¡¢¹ûÓ¬ºÍÄâÄϽæÕâÈý¸ö´ú±íÐÔÎïÖÖµÄÈ«»ùÒò×éÍ»±äÂÊͼÆ×£¬ÆÀ¹ÀЧ¹ûÅú×¢MuRaÔÚÕâЩÎïÖÖÖеÄÔ¤²âÐÔÄܶ¼Ï൱²»´í¡£¡£¡£¡£MuRaL»¹ÄÜʹÓÃԤѵÁ·µÄÄ£×Ó¾ÙÐÐǨáãѧϰ£¬¸ßЧ¿ìËٵػñµÃ½üÔ´ÎïÖÖµÄÍ»±äÂÊͼÆ×¡£¡£¡£¡£ÒÔºãºÓºïΪÀý£¬ÓÉÓÚºãºÓºïÊÇÈËÀàµÄ½üÔ´ÎïÖÖ£¬×÷ÕßʹÓÃѵÁ·ºÃµÄÈËÀàMuRaLÄ£×ӵIJÎÊý×÷Ϊ³õʼ²ÎÊý£¬½öʹÓúãºÓºïÖØÐÂÔ¤²âÄ£×ÓѵÁ·Êý¾ÝµÄ30%¾ÙÐÐǨáãѧϰģ×ÓµÄѵÁ·¡£¡£¡£¡£Ð§¹ûÅú×¢£¬ÖØÐÂѵÁ·Ä£×ÓºÍǨáãѧϰģ×ÓµÄÔ¤²âÐÔÄÜÌåÏÖÏà½ü£¬µ«Ç¨áãѧϰģ×ÓËùÐèÒªµÄѵÁ·Êý¾ÝºÍÅÌËã×ÊÔ´ÒªÉÙÐí¶à¡£¡£¡£¡£


73C6BC069CB8F3D83AE092A1EFF_1C992843_13BE2

ͼ 3. ʹÓÃMuRaL¹¹½¨ÄâÄϽæµÄ»ùÒò×éÍ»±äÂÊͼÆ×


MuRaLÔ¤²âµÄ¸ß¾«¶ÈÍ»±äÂÊͼÆ×¿ÉÓ¦ÓÃÓÚÐí¶àÏÂÓÎÆÊÎö¡£¡£¡£¡£×÷ΪÀý×Ó£¬×÷Õß»ùÓÚÈËÀàMuRaLÄ£×ÓµÄÔ¤²âЧ¹û£¬¶ÔÈËÀà±àÂë»ùÒò¼°ÆäÉÏÏÂÓÎ3 KbÇøÓòµÄÍ»±äÂÊģʽ¾ÙÐоÛÀàÆÊÎö£¬°ÑËùÓлùÒò·ÖΪÈý´óÀࣨͼ4£©¡£¡£¡£¡£º£º£ºÜÓÐÒâ˼µÄÊÇ£¬ÆäÖÐÒ»Àà»ùÒòÔÚ»ùÒòÇø¼°ÉÏÏÂÓζ¼³ÊÏÖ³öÁËÏÔןü¸ßµÄÍ»±äÂÊ£¬¹¦Ð§¸»¼¯ÆÊÎöÅú×¢ÕâÀà¸ßÍ»±äÂʵĻùÒòÐí¶àÓë·¢ÓýÏà¹Ø£¬ËµÃ÷Ðí¶à·¢ÓýÏà¹Ø»ùÒò¾ßÓиü¸ßµÄÍ»±ä¼ç¸º¡£¡£¡£¡£ÕâÊÇÒ»¸ö³öºõÒâÁϵķ¢Ã÷£¬¶ÔÃ÷È·¼²²¡±¬·¢¼°ÉúÎïÑÝ»¯¿ÉÄÜÓÐÖ÷ÒªÒâÒå¡£¡£¡£¡£

53C3C407C9EE31000D35FB844C3_977C9F4C_2982D

ͼ 4. ƾ֤MuRaLÔ¤²âµÄÍ»±äÂʶÔÈËÀà±àÂë»ùÒò¾ÙÐоÛÀà


×ÜÖ®£¬¸ÃÑо¿¿ª·¢ÁËÒ»ÖÖ»ùÓÚÉî¶ÈѧϰԤ²âÍ»±äÂʵÄÒªÁ죬¸ÃÒªÁìÐÔÄÜÓÅÒìÇÒ¾ßÓиßÊÊÓÃÐÔ£¬¿ÉÓÃÓÚ¹¹½¨Ðí¶àÎïÖֵĻùÒò×éÍ»±äÂÊͼÆ×£¬²¢½«Ôö½øÓëÍ»±äÏà¹ØµÄÑо¿£¬¾ßÓÐÁÉÀ«µÄÓ¦ÓÃÔ¶¾°¡£¡£¡£¡£

ngµç×ÓÓÎÏ·ÉúÃü¿ÆÑ§Ñ§ÔºµÄ²©Ê¿Éú·½ÒàÔ²ºÍµËÊéÒæÎª¸ÃÑо¿µÄÅäºÏÒ»×÷£¬Àî²Ê½ÌÊÚΪͨѶ×÷Õß¡£¡£¡£¡£¸ÃÑо¿»ñµÃngµç×ÓÓÎÏ·Óк¦ÉúÎï¿ØÖÆÓë×ÊԴʹÓùú¼ÒÖØµãʵÑéÊÒ¡¢¹ú¼Ò×ÔÈ»¿ÆÑ§»ù½ðίԱ»á¡¢¹ã¶«Ê¡¼°¹ãÖÝÊеľ­·ÑÖ§³Ö¡£¡£¡£¡£

ÂÛÎÄÁ´½Ó£º£º£ºhttps://www.nature.com/articles/s42256-022-00574-5

¡¾ÍøÕ¾µØÍ¼¡¿